Nummer BIOINF4250 (entspricht BIO-4250) |
Titel Computational Single Cell Biology |
Lehrform(en) Praktikum |
---|---|---|
ECTS | 3 | |
Arbeitsaufwand - Kontaktzeit - Selbststudium |
Arbeitsaufwand:
90 h Kontaktzeit:
30 h / 2 SWS Selbststudium:
60 h |
|
Veranstaltungsdauer | 1 Semester | |
Häufigkeit des Angebots | Unregelmäßig | |
Unterrichtssprache | Englisch | |
Prüfungsform | A written report is to be submitted after the course. Performance during the course will also be integrated into the final grade. |
|
Inhalt | The basics of processing and automatically interpreting single-cell datasets are conveyed and applied on concrete examples in this practical course. The course tasks will be implemented in the scripting language Python and R. Specifically this course covers preprocessing, quality control of single-cell transcriptomic data and reconstruction of dynamic processes via RNA velocity analyses, trajectory inference and different dynamic models. |
|
Qualifikationsziele | (1)The students learn how to perform quality control and normalization of single-cell RNA sequencing data. |
|
Vergabe von Leistungspunkten/Benotung |
Lehrform
Status
SWS
LP
Prüfungsform
Prüfungsdauer
Benotung
Berechnung
Modulnote (%) |
|
Teilnahmevoraussetzungen | Es gibt keine besonderen Voraussetzungen. | |
Dozent/in | Claassen | |
Literatur / Sonstiges | Will be supplied during the course. |
|
Zuletzt angeboten | Wintersemester 2022 | |
Geplant für | Wintersemester 2024 | |
Zugeordnete Studienbereiche | BIO-PRAK |