Nummer BIONF4371 (bisher BIO-4371) |
Titel Structure-Based Drug Design |
Lehrform(en) Vorlesung, Übung |
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ECTS | 6 | |
Arbeitsaufwand - Kontaktzeit - Selbststudium |
Arbeitsaufwand:
180 h Kontaktzeit:
60 h / 4 SWS Selbststudium:
120 h |
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Veranstaltungsdauer | 1 Semester | |
Häufigkeit des Angebots | Unregelmäßig | |
Unterrichtssprache | Englisch | |
Prüfungsform | Mündliche Prüfung oder Klausur bei hoher Teilnehmerzahl, 50% der Punkte in den Übungen sind Zulassungsvoraussetzung zur Prüfung, Übungspunkte zählen in begrenztem Umfang als Bonuspunkte in der Prüfung |
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Inhalt | Ausgehend von einer breiten Einführung in den pharmazeutischen Wirkstoffentwicklungsprozess vermittelt die Vorlesung Schlüsselkonzepte des strukturbasierten Computer-Aided Drug Design (CADD). Erforderliche Grundlagen zu pharmazeutischen Schlüsselkonzepten werden diskutiert, gefolgt von grundlegenden Konzepten zur Modellierung von 3D-Strukturen (Liganden und Proteine). Im zweiten Teil werden die wichtigsten physikalisch-chemischen Wechselwirkungen zwischen Proteinen und Liganden vorgestellt, die die Grundlage für die Diskussion von Strategien zur Vorhersage von Protein-Ligand-Bindungen bilden, wobei der Schwerpunkt auf Algorithmen für das Protein-Ligand-Docking liegt. Schließlich wird die anspruchsvolle Aufgabe der Abschätzung von Bindungsaffinitäten zwischen Proteinen und Liganden in silico vorgestellt, was zur Diskussion von Scoring-Funktionen führt, die zu diesem Zweck entwickelt und verwendet werden. |
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Qualifikationsziele | Die Studierenden haben Kenntnisse über den pharmazeutischen Entwicklungsprozess. Sie sind vertraut mit Protein- und Ligandenstrukturen, mit Standardmethoden zu deren experimenteller Auflösung, mit Methoden zur Modellierung von 3D-Strukturen und sind in der Lage, relevante physikochemische Wechselwirkungen zwischen ihnen zu identifizieren. Sie haben detaillierte Kenntnisse über algorithmische Techniken zur Vorhersage von Protein-Ligand-Bindungen (Docking und Scoring). Die Studierenden sind in der Lage, Methoden für die Arbeit mit Protein-Ligand-Strukturen zu implementieren und einfache CADD-Tools zu entwickeln. Die Projektarbeit stärkte ihre Fähigkeit, im Team zu arbeiten und wissenschaftliche Arbeiten niederzuschreiben und zu präsentieren. |
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Vergabe von Leistungspunkten/Benotung |
Lehrform
Status
SWS
LP
Prüfungsform
Prüfungsdauer
Benotung
Berechnung
Modulnote (%) |
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Teilnahmevoraussetzungen | Es gibt keine besonderen Voraussetzungen. | |
Dozent/in | Kohlbacher | |
Literatur / Sonstiges | Lecture slides and additional materials will be provided digitally. Basic knowledge of protein structure, organic chemistry, and programming skills in Python are recommended. Recommended textbooks: |
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Zuletzt angeboten | Sommersemester 2022 | |
Geplant für | Sommersemester 2024 | |
Zugeordnete Studienbereiche | BIO-BIO, INFO-INFO, INFO-PRAK, MEDI-APPL, MEDI-INFO, MEDZ-BIOMED, MEDZ-RES, ML-CS |