Nummer

BIOINF4220 (entspricht BIO-4220)
Titel

Integrative Bioinformatik
Lehrform(en)

Praktikum
ECTS 3
Arbeitsaufwand
- Kontaktzeit
- Selbststudium
Arbeitsaufwand:
90 h
Kontaktzeit:
30 h / 2 SWS
Selbststudium:
60 h
Veranstaltungsdauer 1 Semester
Häufigkeit des Angebots Unregelmäßig
Unterrichtssprache Englisch
Prüfungsform

Nach der Lehrveranstaltung ist ein schriftlicher Bericht abzugeben. Auch studienbegleitende Leistungen fließen in die Abschlussnote ein.

Inhalt

In diesem Praktikum werden die Grundlagen der Modellierung biologischer Daten und der Integration heterogener Datensätze vermittelt und an konkreten Beispielen angewendet. Mit Hilfe der Skriptsprache Python werden die Daten geparst und in einer Datenbank konsolidiert. Auf diesen integrierten Daten werden biologisch relevante, anschauliche Analysen durchgeführt. Datenintegration, -exploration, -visualisierung, statistische Tests und maschinelles Lernen werden auf einen Datensatz aus genomischen, transkriptomischen, metabolomischen und phänomischen Daten von genetisch gleichen Proben angewandt.

Qualifikationsziele

(1) Die Studierenden lernen, wie man heterogene biologische Daten analysiert und in Datenbanken integriert. (2) Sie lernen, statistische Analysen an biologischen Daten durchzuführen und ihre Ergebnisse visuell zusammenzufassen und darzustellen. (3) Sie lernen, die Ergebnisse integrativer Analysen zu interpretieren und diese Ergebnisse in prägnanter Form zu berichten.

Vergabe von Leistungspunkten/Benotung
Lehrform
Status
SWS
LP
Prüfungsform
Prüfungsdauer
Benotung
Berechnung
Modulnote (%)
Praktikum
P
o
3
3.0
H, R
b
100
Teilnahmevoraussetzungen BIOINF4120 (enstpricht BIO-4120) Struktur- und Systembioinformatik
Dozent/in Kohlbacher
Literatur / Sonstiges

Will be supplied during the course.

Zuletzt angeboten Sommersemester 2022
Geplant für Wintersemester 2024
Zugeordnete Studienbereiche BIO-PRAK