Nummer BIOINF4311 (entspricht BIO-4311) |
Titel Mikrobiomanalyse |
Lehrform(en) Vorlesung, Übung |
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ECTS | 6 | |
Arbeitsaufwand - Kontaktzeit - Selbststudium |
Arbeitsaufwand:
180 h Kontaktzeit:
60 h / 4 SWS Selbststudium:
120 h |
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Veranstaltungsdauer | 1 Semester | |
Häufigkeit des Angebots | Unregelmäßig | |
Unterrichtssprache | Englisch | |
Prüfungsform | Klausur oder mündliche Prüfung |
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Inhalt | Dieser Kurs bietet eine ausführliche Einführung in die Mikrobiomanalyse. Die Themen umfassen: Sequenziertechnologien, Erstellung von Gemeinschaftsprofilen mithilfe des SSU rRNA-Gens, Erstellung von Gemeinschaftsprofilen durch Shotgun-Sequenzierung, Alignment-freie und Alignment-basierte taxonomische Profilerstellung, Funktionelle Analyse und Profilerstellung, Probenvergleich und Zeitserienanalyse. |
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Qualifikationsziele | Die Studierenden kennen die neuesten bioinformatischen Erkenntnisse zur Mikrobiomanalyse. Sie können die Herausforderungen der Mikrobiomanalyse für die Bioinformatik formulieren. Sie kennen Algorithmen zur taxonomischen und funktionalen Analyse von Mikrobiom-Sequenzierungsdaten, statistische Methoden zum Vergleich und Methoden zur Erstellung von Community-Profilen anhand von 16S-Sequenzen. Die Studierenden können Mikrobiom-Sequenzierungsdaten analysieren und Profiling und Vergleiche durchführen. Sie kennen sowohl die Möglichkeiten als auch die Grenzen der verschiedenen Methoden in diesem Teilgebiet der Bioinformatik. Sie sind in der Lage, Problemstellungen auf wissenschaftlichem Niveau zu analysieren und schriftlich zusammenzufassen. Insbesondere wird ein hohes Maß an intrinsischer Motivation und Eigenverantwortung gefördert. |
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Vergabe von Leistungspunkten/Benotung |
Lehrform
Status
SWS
LP
Prüfungsform
Prüfungsdauer
Benotung
Berechnung
Modulnote (%)
Vorlesung
V
o
2
4.0
K
90
b
100
Übung
Ü
o
2
2.0
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Teilnahmevoraussetzungen | Es gibt keine besonderen Voraussetzungen. | |
Dozent/in | Huson | |
Literatur / Sonstiges | Lecture notes and scientific publications |
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Zuletzt angeboten | Sommersemester 2021 | |
Geplant für | derzeit nicht geplant | |
Zugeordnete Studienbereiche | BIO-BIO, INFO-INFO, INFO-PRAK, MEDI-APPL, MEDI-INFO, MEDZ-BIOMED, ML-CS |