Nummer

BIOINF3380
Titel

Ausgewählte Themen der Systembiologie
Art der Vorlesung

Wahlpflicht
ECTS 3
Arbeitsaufwand
- Kontaktzeit
- Selbststudium
Arbeitsaufwand:
90 h
Kontaktzeit:
30 h / 2 SWS
Selbststudium:
60 h
Veranstaltungsdauer 1 Semester
Häufigkeit des Angebots Im Wintersemester
Unterrichtssprache Deutsch
Prüfungsform

Vortrag und Ausarbeitung

Lehrform(en) Proseminar
Inhalt

Systembiologie ist ein Gemeinschaftsprojekt vielfältiger wissenschaftlicher Disziplinen mit dem Ziel, aus der Gesamtheit aller Bausteine des Lebens auf den zu erwartenden Phänotyp schließen zu können. Dazu kommen Computermodelle der betrachteten Lebensformen zum Einsatz, deren Simulation Aufschluss über die vielfältigen Vorgänge in lebenden Systemen gewährt. Dieses Proseminar bietet einen weitgefächerten Einblick in vielfältige Bereiche der rechnergestützten Systembiologie.

In ausgewählten Themen werden grundlegende Techniken zur Modellierung und Simulation eingeführt, darunter die auf Einschränkungen basierende Modellierung, kinetische Modellierung, der stochastische Gillespie-Algorithmus, Stichprobenverfahren sowie Anwendungsmöglichkeiten in der Biotechnologie und im Gesundheitswesen.

Die Studierenden präsentieren und diskutieren aktuelle Publikationen in Kombination mit den Grundlagen dahinterstehender Theorien, Methoden und Algorithmen. Durch Diskussionen ausgewählter Publikationen werden die Studierenden lernen, rechnergestützte Modellierung als Werkzeug einzusetzen und experimentelle Daten in die Modelle einfließen lassen können.

- Erlernen grundlegender Konzepte in der biologischen Netzwerkmodellierung für einen integrativen Ansatz zur Untersuchung lebender Systeme.
- Erwerb von Fähigkeiten zum Verständnis der Konzepte mathematischer oder rechnergestützter Modelle biologischer Systeme und ihrer Analyse im Kontext von Labordatensätzen.
- Vertrautheit mit wesentlichen Computerwerkzeugen zur Konstruktion der Modelle.
- Verständnis der Terminologie in systembiologischen Publikationen.

Qualifikationsziele

Die Studierenden erwerben einen weitgefächerten Überblick der Systembiologie.

Vergabe von Leistungspunkten/Benotung
Lehrform
Status
SWS
LP
Prüfungsform
Prüfungsdauer
Benotung
Berechnung
Modulnote (%)
Teilnahmevoraussetzungen Es gibt keine besonderen Voraussetzungen.
Dozent/in
Literatur / Sonstiges

Herbert M. Sauro, Systems Biology: Introduction to Pathway Modeling. Ambrosius Publishing, 2018.
- Reinhart Heinrich und Stefan Schuster. The regulation of cellular systems. Springer, 2012.
- Reihaneh Mostolizadeh, Andreas Dräger und Neema Jamshidi. Insights into Dynamic Network States Using Metabolomic Data. In: Angelo D'Alessandro (Editor) High-Throughput Metabolomics. Methods in Molecular Biology, Band 1978, Kapitel, Seiten 243-258. Humana, New York, NY, 23. Mai 2019.
- Palsson, Bernhard Ø. Systems Biology: Properties of Reconstructed Networks. Cambridge University Press, 2007.
- Palsson, Bernhard Ø. Systems Biology: Constraint-based Reconstruction and Analysis. Cambridge University Press, 2015.
- Weitere Publikationen werden in der Veranstaltung ausgegeben.

Zuletzt angeboten nicht bekannt
Geplant für derzeit nicht geplant
Zugeordnete Studienbereiche BIOINFM1510, MDZINFM1510